Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE1BQ01064 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE1BQ01064 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE1BQ01064 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms