Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CLTCQ00610 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CLTCQ00610 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CLTCQ00610 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CLTCQ00610 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CLTCQ00610 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CLTCQ00610 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CLTCQ00610 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CLTCQ00610 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CLTCQ00610 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
CLTCQ00610 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CLTCQ00610 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CLTCQ00610 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CLTCQ00610 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CLTCQ00610 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CLTCQ00610 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CLTCQ00610 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CLTCQ00610 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CLTCQ00610 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CLTCQ00610 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CLTCQ00610 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CLTCQ00610 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CLTCQ00610 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CLTCQ00610 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CLTCQ00610 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLTCQ00610 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CLTCQ00610 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms