Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3F3AP84243 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3F3AP84243 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3F3AP84243 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H3F3AP84243 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms