Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUCB2P80303 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUCB2P80303 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUCB2P80303 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUCB2P80303 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms