Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB25P57735 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB25P57735 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB25P57735 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB25P57735 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB25P57735 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB25P57735 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB25P57735 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB25P57735 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB25P57735 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB25P57735 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB25P57735 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB25P57735 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB25P57735 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB25P57735 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB25P57735 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB25P57735 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB25P57735 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB25P57735 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB25P57735 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB25P57735 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB25P57735 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB25P57735 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB25P57735 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB25P57735 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB25P57735 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB25P57735 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB25P57735 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB25P57735 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB25P57735 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB25P57735 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB25P57735 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB25P57735 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB25P57735 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB25P57735 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB25P57735 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB25P57735 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB25P57735 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB25P57735 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB25P57735 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB25P57735 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB25P57735 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB25P57735 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB25P57735 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB25P57735 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB25P57735 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB25P57735 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB25P57735 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB25P57735 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB25P57735 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB25P57735 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB25P57735 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB25P57735 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB25P57735 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB25P57735 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB25P57735 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB25P57735 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB25P57735 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB25P57735 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB25P57735 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB25P57735 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB25P57735 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB25P57735 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB25P57735 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB25P57735 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB25P57735 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB25P57735 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB25P57735 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB25P57735 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB25P57735 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB25P57735 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB25P57735 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB25P57735 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB25P57735 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB25P57735 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB25P57735 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB25P57735 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB25P57735 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB25P57735 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB25P57735 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB25P57735 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB25P57735 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB25P57735 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB25P57735 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB25P57735 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB25P57735 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB25P57735 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB25P57735 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB25P57735 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB25P57735 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB25P57735 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB25P57735 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB25P57735 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB25P57735 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB25P57735 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB25P57735 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB25P57735 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB25P57735 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB25P57735 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB25P57735 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms