Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD23AP54725 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23AP54725 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23AP54725 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms