Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLNS1AP54105 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLNS1AP54105 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLNS1AP54105 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms