Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVDP53602 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVDP53602 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MVDP53602 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVDP53602 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVDP53602 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVDP53602 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MVDP53602 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVDP53602 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVDP53602 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVDP53602 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MVDP53602 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVDP53602 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVDP53602 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVDP53602 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVDP53602 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVDP53602 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVDP53602 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVDP53602 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVDP53602 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MVDP53602 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MVDP53602 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MVDP53602 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVDP53602 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVDP53602 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVDP53602 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVDP53602 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVDP53602 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVDP53602 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVDP53602 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVDP53602 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MVDP53602 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MVDP53602 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MVDP53602 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MVDP53602 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVDP53602 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVDP53602 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MVDP53602 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVDP53602 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MVDP53602 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVDP53602 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVDP53602 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVDP53602 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MVDP53602 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MVDP53602 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MVDP53602 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVDP53602 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVDP53602 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVDP53602 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVDP53602 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVDP53602 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVDP53602 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVDP53602 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVDP53602 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVDP53602 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVDP53602 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MVDP53602 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MVDP53602 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MVDP53602 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MVDP53602 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVDP53602 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVDP53602 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVDP53602 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVDP53602 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVDP53602 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVDP53602 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MVDP53602 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MVDP53602 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MVDP53602 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MVDP53602 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MVDP53602 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MVDP53602 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MVDP53602 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MVDP53602 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MVDP53602 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MVDP53602 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MVDP53602 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MVDP53602 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MVDP53602 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MVDP53602 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MVDP53602 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MVDP53602 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVDP53602 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVDP53602 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVDP53602 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVDP53602 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVDP53602 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVDP53602 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MVDP53602 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MVDP53602 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MVDP53602 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MVDP53602 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MVDP53602 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MVDP53602 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MVDP53602 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MVDP53602 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MVDP53602 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MVDP53602 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MVDP53602 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MVDP53602 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms