Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2A1P52655 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A1P52655 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A1P52655 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF2A1P52655 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms