Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
APLP1P51693 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
APLP1P51693 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
APLP1P51693 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
APLP1P51693 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
APLP1P51693 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
APLP1P51693 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
APLP1P51693 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
APLP1P51693 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
APLP1P51693 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
APLP1P51693 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
APLP1P51693 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
APLP1P51693 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
APLP1P51693 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
APLP1P51693 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
APLP1P51693 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
APLP1P51693 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
APLP1P51693 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
APLP1P51693 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
APLP1P51693 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
APLP1P51693 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
APLP1P51693 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
APLP1P51693 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
APLP1P51693 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
APLP1P51693 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
APLP1P51693 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
APLP1P51693 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
APLP1P51693 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
APLP1P51693 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
APLP1P51693 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
APLP1P51693 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
APLP1P51693 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
APLP1P51693 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
APLP1P51693 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
APLP1P51693 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
APLP1P51693 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
APLP1P51693 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
APLP1P51693 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
APLP1P51693 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
APLP1P51693 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
APLP1P51693 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
APLP1P51693 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
APLP1P51693 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
APLP1P51693 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
APLP1P51693 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
APLP1P51693 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
APLP1P51693 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
APLP1P51693 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
APLP1P51693 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
APLP1P51693 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
APLP1P51693 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
APLP1P51693 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31■■■□□ 2.55
APLP1P51693 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
APLP1P51693 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
APLP1P51693 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
APLP1P51693 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
APLP1P51693 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
APLP1P51693 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
APLP1P51693 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
APLP1P51693 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
APLP1P51693 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
APLP1P51693 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
APLP1P51693 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
APLP1P51693 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
APLP1P51693 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
APLP1P51693 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
APLP1P51693 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
APLP1P51693 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
APLP1P51693 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
APLP1P51693 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
APLP1P51693 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
APLP1P51693 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
APLP1P51693 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
APLP1P51693 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
APLP1P51693 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
APLP1P51693 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
APLP1P51693 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
APLP1P51693 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
APLP1P51693 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
APLP1P51693 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
APLP1P51693 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
APLP1P51693 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
APLP1P51693 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
APLP1P51693 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
APLP1P51693 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
APLP1P51693 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
APLP1P51693 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
APLP1P51693 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
APLP1P51693 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
APLP1P51693 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
APLP1P51693 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
APLP1P51693 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
APLP1P51693 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
APLP1P51693 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
APLP1P51693 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
APLP1P51693 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
APLP1P51693 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
APLP1P51693 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
APLP1P51693 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
APLP1P51693 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms