Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE6CP51160 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
PDE6CP51160 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PDE6CP51160 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE6CP51160 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE6CP51160 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE6CP51160 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDE6CP51160 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDE6CP51160 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6CP51160 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6CP51160 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6CP51160 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6CP51160 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6CP51160 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6CP51160 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE6CP51160 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE6CP51160 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE6CP51160 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6CP51160 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6CP51160 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6CP51160 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6CP51160 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6CP51160 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6CP51160 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6CP51160 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6CP51160 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE6CP51160 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PDE6CP51160 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PDE6CP51160 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE6CP51160 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE6CP51160 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms