Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRIM1P49642 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PRIM1P49642 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PRIM1P49642 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRIM1P49642 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PRIM1P49642 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRIM1P49642 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PRIM1P49642 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRIM1P49642 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PRIM1P49642 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRIM1P49642 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRIM1P49642 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PRIM1P49642 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRIM1P49642 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRIM1P49642 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PRIM1P49642 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
PRIM1P49642 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PRIM1P49642 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PRIM1P49642 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PRIM1P49642 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PRIM1P49642 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PRIM1P49642 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PRIM1P49642 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRIM1P49642 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
PRIM1P49642 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PRIM1P49642 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.76■■■■□ 3
PRIM1P49642 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRIM1P49642 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRIM1P49642 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRIM1P49642 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRIM1P49642 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRIM1P49642 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRIM1P49642 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PRIM1P49642 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRIM1P49642 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PRIM1P49642 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRIM1P49642 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRIM1P49642 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRIM1P49642 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PRIM1P49642 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRIM1P49642 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PRIM1P49642 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms