Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PBX3P40426 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX3P40426 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX3P40426 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX3P40426 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX3P40426 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX3P40426 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX3P40426 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX3P40426 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX3P40426 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX3P40426 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX3P40426 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PBX3P40426 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PBX3P40426 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PBX3P40426 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PBX3P40426 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PBX3P40426 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PBX3P40426 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBX3P40426 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PBX3P40426 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBX3P40426 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PBX3P40426 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBX3P40426 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PBX3P40426 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBX3P40426 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBX3P40426 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PBX3P40426 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PBX3P40426 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBX3P40426 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBX3P40426 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PBX3P40426 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PBX3P40426 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PBX3P40426 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PBX3P40426 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PBX3P40426 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PBX3P40426 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PBX3P40426 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PBX3P40426 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PBX3P40426 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PBX3P40426 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PBX3P40426 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PBX3P40426 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PBX3P40426 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PBX3P40426 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PBX3P40426 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PBX3P40426 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PBX3P40426 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PBX3P40426 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PBX3P40426 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBX3P40426 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBX3P40426 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PBX3P40426 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PBX3P40426 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PBX3P40426 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBX3P40426 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBX3P40426 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBX3P40426 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PBX3P40426 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PBX3P40426 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBX3P40426 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBX3P40426 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX3P40426 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX3P40426 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBX3P40426 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PBX3P40426 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBX3P40426 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBX3P40426 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PBX3P40426 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PBX3P40426 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBX3P40426 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PBX3P40426 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PBX3P40426 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBX3P40426 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBX3P40426 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBX3P40426 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBX3P40426 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBX3P40426 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PBX3P40426 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBX3P40426 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PBX3P40426 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PBX3P40426 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PBX3P40426 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PBX3P40426 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PBX3P40426 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PBX3P40426 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PBX3P40426 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PBX3P40426 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PBX3P40426 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX3P40426 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PBX3P40426 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PBX3P40426 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PBX3P40426 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PBX3P40426 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PBX3P40426 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBX3P40426 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBX3P40426 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBX3P40426 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBX3P40426 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBX3P40426 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PBX3P40426 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms