Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR7P32248 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR7P32248 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR7P32248 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR7P32248 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR7P32248 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR7P32248 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR7P32248 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR7P32248 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR7P32248 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR7P32248 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR7P32248 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR7P32248 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR7P32248 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR7P32248 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR7P32248 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR7P32248 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR7P32248 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR7P32248 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR7P32248 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR7P32248 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR7P32248 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR7P32248 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR7P32248 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR7P32248 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR7P32248 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR7P32248 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR7P32248 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR7P32248 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR7P32248 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR7P32248 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR7P32248 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR7P32248 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR7P32248 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR7P32248 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR7P32248 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR7P32248 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR7P32248 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR7P32248 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR7P32248 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR7P32248 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR7P32248 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR7P32248 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR7P32248 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR7P32248 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCR7P32248 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCR7P32248 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCR7P32248 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCR7P32248 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR7P32248 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR7P32248 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR7P32248 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR7P32248 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR7P32248 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCR7P32248 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCR7P32248 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCR7P32248 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCR7P32248 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR7P32248 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR7P32248 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR7P32248 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR7P32248 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR7P32248 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR7P32248 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR7P32248 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR7P32248 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR7P32248 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR7P32248 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR7P32248 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR7P32248 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR7P32248 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR7P32248 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR7P32248 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR7P32248 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR7P32248 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR7P32248 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR7P32248 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCR7P32248 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR7P32248 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR7P32248 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR7P32248 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR7P32248 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR7P32248 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR7P32248 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR7P32248 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR7P32248 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR7P32248 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR7P32248 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR7P32248 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR7P32248 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR7P32248 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR7P32248 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR7P32248 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR7P32248 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR7P32248 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR7P32248 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCR7P32248 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCR7P32248 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCR7P32248 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCR7P32248 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms