Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCKBRP32239 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCKBRP32239 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCKBRP32239 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCKBRP32239 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms