Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRA5P31644 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRA5P31644 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA5P31644 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154 ms