Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN6P29350 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN6P29350 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN6P29350 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN6P29350 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN6P29350 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN6P29350 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN6P29350 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN6P29350 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms