Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMB9P28065 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB9P28065 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB9P28065 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms