Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
S100A1P23297 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
S100A1P23297 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
S100A1P23297 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
S100A1P23297 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
S100A1P23297 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
S100A1P23297 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S100A1P23297 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
S100A1P23297 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S100A1P23297 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
S100A1P23297 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
S100A1P23297 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
S100A1P23297 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
S100A1P23297 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
S100A1P23297 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
S100A1P23297 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
S100A1P23297 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
S100A1P23297 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
S100A1P23297 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
S100A1P23297 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
S100A1P23297 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
S100A1P23297 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
S100A1P23297 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
S100A1P23297 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
S100A1P23297 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
S100A1P23297 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
S100A1P23297 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
S100A1P23297 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
S100A1P23297 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
S100A1P23297 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
S100A1P23297 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
S100A1P23297 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
S100A1P23297 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
S100A1P23297 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
S100A1P23297 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
S100A1P23297 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
S100A1P23297 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
S100A1P23297 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
S100A1P23297 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
S100A1P23297 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
S100A1P23297 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
S100A1P23297 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
S100A1P23297 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
S100A1P23297 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
S100A1P23297 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
S100A1P23297 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
S100A1P23297 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
S100A1P23297 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
S100A1P23297 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
S100A1P23297 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
S100A1P23297 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
S100A1P23297 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
S100A1P23297 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
S100A1P23297 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
S100A1P23297 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
S100A1P23297 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
S100A1P23297 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
S100A1P23297 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
S100A1P23297 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
S100A1P23297 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
S100A1P23297 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
S100A1P23297 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
S100A1P23297 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
S100A1P23297 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
S100A1P23297 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
S100A1P23297 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
S100A1P23297 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
S100A1P23297 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
S100A1P23297 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
S100A1P23297 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
S100A1P23297 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
S100A1P23297 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
S100A1P23297 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
S100A1P23297 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
S100A1P23297 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
S100A1P23297 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
S100A1P23297 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
S100A1P23297 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
S100A1P23297 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
S100A1P23297 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
S100A1P23297 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
S100A1P23297 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
S100A1P23297 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
S100A1P23297 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
S100A1P23297 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
S100A1P23297 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
S100A1P23297 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
S100A1P23297 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
S100A1P23297 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
S100A1P23297 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
S100A1P23297 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
S100A1P23297 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
S100A1P23297 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
S100A1P23297 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
S100A1P23297 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
S100A1P23297 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
S100A1P23297 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
S100A1P23297 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
S100A1P23297 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
S100A1P23297 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms