Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACBP22694 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKACBP22694 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACBP22694 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms