Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BGNP21810 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BGNP21810 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BGNP21810 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BGNP21810 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BGNP21810 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BGNP21810 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BGNP21810 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BGNP21810 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BGNP21810 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BGNP21810 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BGNP21810 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BGNP21810 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BGNP21810 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BGNP21810 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BGNP21810 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BGNP21810 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BGNP21810 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BGNP21810 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BGNP21810 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BGNP21810 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BGNP21810 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BGNP21810 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BGNP21810 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BGNP21810 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BGNP21810 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BGNP21810 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BGNP21810 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BGNP21810 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BGNP21810 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BGNP21810 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BGNP21810 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BGNP21810 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BGNP21810 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BGNP21810 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BGNP21810 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BGNP21810 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BGNP21810 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BGNP21810 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BGNP21810 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BGNP21810 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BGNP21810 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BGNP21810 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BGNP21810 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BGNP21810 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BGNP21810 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BGNP21810 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BGNP21810 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BGNP21810 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BGNP21810 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BGNP21810 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BGNP21810 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BGNP21810 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BGNP21810 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BGNP21810 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BGNP21810 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BGNP21810 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BGNP21810 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BGNP21810 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BGNP21810 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BGNP21810 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BGNP21810 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BGNP21810 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BGNP21810 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BGNP21810 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BGNP21810 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BGNP21810 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BGNP21810 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BGNP21810 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BGNP21810 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BGNP21810 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BGNP21810 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BGNP21810 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BGNP21810 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BGNP21810 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BGNP21810 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BGNP21810 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BGNP21810 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BGNP21810 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BGNP21810 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BGNP21810 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BGNP21810 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BGNP21810 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BGNP21810 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BGNP21810 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BGNP21810 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms