Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BGNP21810 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BGNP21810 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BGNP21810 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BGNP21810 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BGNP21810 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BGNP21810 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BGNP21810 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BGNP21810 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BGNP21810 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BGNP21810 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BGNP21810 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BGNP21810 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BGNP21810 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BGNP21810 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BGNP21810 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BGNP21810 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BGNP21810 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BGNP21810 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BGNP21810 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BGNP21810 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BGNP21810 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BGNP21810 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BGNP21810 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BGNP21810 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BGNP21810 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BGNP21810 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BGNP21810 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BGNP21810 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BGNP21810 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BGNP21810 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BGNP21810 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BGNP21810 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BGNP21810 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BGNP21810 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BGNP21810 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BGNP21810 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BGNP21810 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BGNP21810 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BGNP21810 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BGNP21810 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BGNP21810 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BGNP21810 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BGNP21810 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BGNP21810 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BGNP21810 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BGNP21810 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BGNP21810 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BGNP21810 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BGNP21810 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BGNP21810 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BGNP21810 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BGNP21810 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BGNP21810 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BGNP21810 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BGNP21810 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BGNP21810 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BGNP21810 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BGNP21810 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BGNP21810 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BGNP21810 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BGNP21810 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BGNP21810 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BGNP21810 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BGNP21810 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BGNP21810 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BGNP21810 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BGNP21810 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BGNP21810 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BGNP21810 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BGNP21810 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BGNP21810 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BGNP21810 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BGNP21810 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BGNP21810 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BGNP21810 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BGNP21810 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BGNP21810 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BGNP21810 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BGNP21810 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BGNP21810 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BGNP21810 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BGNP21810 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BGNP21810 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BGNP21810 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BGNP21810 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BGNP21810 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BGNP21810 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms