Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD247P20963 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD247P20963 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD247P20963 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD247P20963 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD247P20963 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD247P20963 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD247P20963 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD247P20963 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD247P20963 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD247P20963 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD247P20963 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD247P20963 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD247P20963 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD247P20963 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD247P20963 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD247P20963 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD247P20963 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD247P20963 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD247P20963 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD247P20963 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD247P20963 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD247P20963 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD247P20963 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD247P20963 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD247P20963 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD247P20963 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD247P20963 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD247P20963 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD247P20963 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD247P20963 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD247P20963 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CD247P20963 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD247P20963 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD247P20963 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD247P20963 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD247P20963 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD247P20963 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD247P20963 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD247P20963 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD247P20963 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD247P20963 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD247P20963 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD247P20963 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD247P20963 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD247P20963 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD247P20963 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD247P20963 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD247P20963 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD247P20963 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD247P20963 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD247P20963 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD247P20963 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD247P20963 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD247P20963 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD247P20963 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD247P20963 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD247P20963 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD247P20963 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD247P20963 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD247P20963 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD247P20963 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD247P20963 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD247P20963 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD247P20963 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD247P20963 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD247P20963 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD247P20963 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD247P20963 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD247P20963 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD247P20963 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD247P20963 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD247P20963 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD247P20963 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD247P20963 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD247P20963 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD247P20963 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD247P20963 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD247P20963 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD247P20963 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD247P20963 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD247P20963 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CD247P20963 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD247P20963 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD247P20963 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD247P20963 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD247P20963 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD247P20963 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD247P20963 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD247P20963 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD247P20963 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD247P20963 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD247P20963 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD247P20963 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD247P20963 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD247P20963 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD247P20963 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD247P20963 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CD247P20963 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD247P20963 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms