Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
TRHP20396 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TRHP20396 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TRHP20396 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TRHP20396 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TRHP20396 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TRHP20396 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
TRHP20396 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
TRHP20396 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
TRHP20396 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC41.45■■■■■ 4.23
TRHP20396 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
TRHP20396 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
TRHP20396 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
TRHP20396 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TRHP20396 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
TRHP20396 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
TRHP20396 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
TRHP20396 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
TRHP20396 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
TRHP20396 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
TRHP20396 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TRHP20396 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
TRHP20396 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TRHP20396 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
TRHP20396 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
TRHP20396 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
TRHP20396 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TRHP20396 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
TRHP20396 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
TRHP20396 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TRHP20396 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TRHP20396 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TRHP20396 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TRHP20396 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TRHP20396 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
TRHP20396 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
TRHP20396 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
TRHP20396 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
TRHP20396 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TRHP20396 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TRHP20396 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
TRHP20396 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
TRHP20396 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TRHP20396 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TRHP20396 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
TRHP20396 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
TRHP20396 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC41.26■■■■■ 4.2
TRHP20396 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TRHP20396 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TRHP20396 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TRHP20396 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TRHP20396 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
TRHP20396 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
TRHP20396 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TRHP20396 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TRHP20396 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TRHP20396 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
TRHP20396 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
TRHP20396 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TRHP20396 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
TRHP20396 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TRHP20396 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
TRHP20396 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TRHP20396 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TRHP20396 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
TRHP20396 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TRHP20396 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TRHP20396 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
TRHP20396 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
TRHP20396 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
TRHP20396 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
TRHP20396 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
TRHP20396 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
TRHP20396 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
TRHP20396 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
TRHP20396 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
TRHP20396 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TRHP20396 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
TRHP20396 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TRHP20396 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TRHP20396 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
TRHP20396 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TRHP20396 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
TRHP20396 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TRHP20396 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TRHP20396 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
TRHP20396 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TRHP20396 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
TRHP20396 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
TRHP20396 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TRHP20396 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TRHP20396 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
TRHP20396 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC41.02■■■■■ 4.16
TRHP20396 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TRHP20396 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TRHP20396 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TRHP20396 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TRHP20396 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
TRHP20396 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TRHP20396 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms