Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI3P19429 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3P19429 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3P19429 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms