Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHN1P15882 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHN1P15882 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHN1P15882 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHN1P15882 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHN1P15882 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHN1P15882 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHN1P15882 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHN1P15882 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHN1P15882 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHN1P15882 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHN1P15882 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHN1P15882 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHN1P15882 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHN1P15882 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHN1P15882 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHN1P15882 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHN1P15882 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHN1P15882 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHN1P15882 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHN1P15882 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHN1P15882 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHN1P15882 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHN1P15882 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHN1P15882 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHN1P15882 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHN1P15882 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHN1P15882 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHN1P15882 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHN1P15882 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHN1P15882 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHN1P15882 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHN1P15882 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHN1P15882 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHN1P15882 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHN1P15882 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHN1P15882 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHN1P15882 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHN1P15882 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHN1P15882 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHN1P15882 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHN1P15882 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHN1P15882 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHN1P15882 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHN1P15882 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHN1P15882 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHN1P15882 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHN1P15882 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHN1P15882 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHN1P15882 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHN1P15882 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHN1P15882 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHN1P15882 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHN1P15882 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHN1P15882 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHN1P15882 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHN1P15882 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHN1P15882 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHN1P15882 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHN1P15882 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHN1P15882 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHN1P15882 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHN1P15882 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHN1P15882 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHN1P15882 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHN1P15882 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHN1P15882 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHN1P15882 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHN1P15882 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHN1P15882 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHN1P15882 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHN1P15882 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHN1P15882 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHN1P15882 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHN1P15882 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHN1P15882 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHN1P15882 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHN1P15882 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHN1P15882 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHN1P15882 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHN1P15882 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHN1P15882 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHN1P15882 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHN1P15882 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHN1P15882 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHN1P15882 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHN1P15882 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHN1P15882 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHN1P15882 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHN1P15882 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHN1P15882 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHN1P15882 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHN1P15882 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHN1P15882 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHN1P15882 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHN1P15882 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHN1P15882 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHN1P15882 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHN1P15882 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHN1P15882 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms