Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf89P0DMQ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf89P0DMQ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf89P0DMQ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf89P0DMQ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf89P0DMQ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C8orf89P0DMQ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C8orf89P0DMQ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf89P0DMQ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8orf89P0DMQ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C8orf89P0DMQ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf89P0DMQ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms