Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTXN2P0C2S0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTXN2P0C2S0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN2P0C2S0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms