Protein–RNA interactions for Protein: P08922

ROS1, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ROS, humanhuman

Predictions only

Length 2,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROS1P08922 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROS1P08922 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROS1P08922 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROS1P08922 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROS1P08922 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROS1P08922 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROS1P08922 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROS1P08922 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROS1P08922 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROS1P08922 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROS1P08922 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROS1P08922 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROS1P08922 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROS1P08922 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROS1P08922 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROS1P08922 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROS1P08922 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROS1P08922 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ROS1P08922 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ROS1P08922 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROS1P08922 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ROS1P08922 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROS1P08922 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ROS1P08922 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROS1P08922 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROS1P08922 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ROS1P08922 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROS1P08922 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROS1P08922 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROS1P08922 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROS1P08922 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROS1P08922 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ROS1P08922 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROS1P08922 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROS1P08922 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROS1P08922 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROS1P08922 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROS1P08922 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROS1P08922 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROS1P08922 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROS1P08922 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROS1P08922 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROS1P08922 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROS1P08922 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROS1P08922 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROS1P08922 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROS1P08922 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROS1P08922 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROS1P08922 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROS1P08922 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROS1P08922 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROS1P08922 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROS1P08922 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ROS1P08922 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROS1P08922 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROS1P08922 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROS1P08922 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROS1P08922 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROS1P08922 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROS1P08922 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROS1P08922 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROS1P08922 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ROS1P08922 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ROS1P08922 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROS1P08922 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROS1P08922 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ROS1P08922 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROS1P08922 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROS1P08922 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROS1P08922 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ROS1P08922 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ROS1P08922 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ROS1P08922 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ROS1P08922 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ROS1P08922 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ROS1P08922 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ROS1P08922 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROS1P08922 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROS1P08922 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROS1P08922 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROS1P08922 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROS1P08922 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROS1P08922 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROS1P08922 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms