Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOP08100 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOP08100 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOP08100 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOP08100 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOP08100 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOP08100 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOP08100 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOP08100 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RHOP08100 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOP08100 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOP08100 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOP08100 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOP08100 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOP08100 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOP08100 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOP08100 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOP08100 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOP08100 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHOP08100 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHOP08100 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOP08100 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOP08100 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOP08100 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOP08100 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOP08100 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOP08100 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOP08100 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOP08100 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOP08100 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOP08100 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOP08100 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOP08100 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOP08100 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOP08100 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOP08100 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOP08100 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOP08100 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOP08100 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOP08100 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOP08100 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOP08100 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOP08100 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOP08100 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOP08100 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOP08100 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RHOP08100 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOP08100 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOP08100 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOP08100 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHOP08100 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHOP08100 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOP08100 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOP08100 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOP08100 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOP08100 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOP08100 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOP08100 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOP08100 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOP08100 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOP08100 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOP08100 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOP08100 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOP08100 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOP08100 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOP08100 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOP08100 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOP08100 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOP08100 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOP08100 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHOP08100 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOP08100 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOP08100 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOP08100 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOP08100 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOP08100 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOP08100 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOP08100 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOP08100 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOP08100 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOP08100 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOP08100 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOP08100 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOP08100 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOP08100 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOP08100 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms