Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPM2P07951 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPM2P07951 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPM2P07951 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TPM2P07951 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPM2P07951 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPM2P07951 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM2P07951 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM2P07951 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM2P07951 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM2P07951 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM2P07951 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM2P07951 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM2P07951 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPM2P07951 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPM2P07951 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPM2P07951 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPM2P07951 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPM2P07951 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPM2P07951 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPM2P07951 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPM2P07951 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPM2P07951 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPM2P07951 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPM2P07951 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPM2P07951 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPM2P07951 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPM2P07951 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPM2P07951 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPM2P07951 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPM2P07951 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPM2P07951 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPM2P07951 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPM2P07951 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPM2P07951 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPM2P07951 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPM2P07951 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM2P07951 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM2P07951 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM2P07951 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM2P07951 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM2P07951 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM2P07951 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM2P07951 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM2P07951 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPM2P07951 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TPM2P07951 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPM2P07951 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TPM2P07951 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPM2P07951 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPM2P07951 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPM2P07951 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPM2P07951 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPM2P07951 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPM2P07951 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPM2P07951 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPM2P07951 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPM2P07951 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPM2P07951 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPM2P07951 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPM2P07951 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPM2P07951 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TPM2P07951 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPM2P07951 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPM2P07951 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPM2P07951 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPM2P07951 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPM2P07951 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPM2P07951 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPM2P07951 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPM2P07951 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPM2P07951 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPM2P07951 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPM2P07951 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TPM2P07951 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPM2P07951 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPM2P07951 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPM2P07951 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPM2P07951 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPM2P07951 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPM2P07951 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPM2P07951 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPM2P07951 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPM2P07951 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPM2P07951 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPM2P07951 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPM2P07951 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPM2P07951 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPM2P07951 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPM2P07951 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPM2P07951 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPM2P07951 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPM2P07951 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPM2P07951 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPM2P07951 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPM2P07951 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPM2P07951 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPM2P07951 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPM2P07951 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPM2P07951 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms