Protein–RNA interactions for Protein: P05787

KRT8, Keratin, type II cytoskeletal 8, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8P05787 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT8P05787 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT8P05787 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT8P05787 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT8P05787 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT8P05787 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT8P05787 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT8P05787 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT8P05787 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT8P05787 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT8P05787 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT8P05787 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT8P05787 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT8P05787 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT8P05787 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT8P05787 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT8P05787 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT8P05787 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT8P05787 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT8P05787 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT8P05787 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT8P05787 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT8P05787 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT8P05787 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT8P05787 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT8P05787 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT8P05787 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT8P05787 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT8P05787 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT8P05787 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT8P05787 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT8P05787 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT8P05787 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT8P05787 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT8P05787 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT8P05787 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT8P05787 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT8P05787 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT8P05787 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT8P05787 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT8P05787 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT8P05787 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT8P05787 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT8P05787 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT8P05787 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT8P05787 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT8P05787 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT8P05787 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT8P05787 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT8P05787 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT8P05787 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT8P05787 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT8P05787 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT8P05787 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT8P05787 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT8P05787 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT8P05787 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT8P05787 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT8P05787 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT8P05787 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT8P05787 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT8P05787 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT8P05787 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT8P05787 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT8P05787 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT8P05787 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT8P05787 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT8P05787 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT8P05787 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT8P05787 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT8P05787 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT8P05787 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT8P05787 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT8P05787 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT8P05787 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT8P05787 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT8P05787 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT8P05787 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT8P05787 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT8P05787 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT8P05787 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT8P05787 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT8P05787 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT8P05787 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT8P05787 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT8P05787 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT8P05787 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT8P05787 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT8P05787 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT8P05787 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT8P05787 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT8P05787 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT8P05787 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT8P05787 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT8P05787 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT8P05787 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT8P05787 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT8P05787 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT8P05787 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT8P05787 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms