Protein–RNA interactions for Protein: P05231

IL6, Interleukin-6, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL6P05231 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IL6P05231 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IL6P05231 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IL6P05231 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL6P05231 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL6P05231 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL6P05231 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IL6P05231 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL6P05231 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IL6P05231 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IL6P05231 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IL6P05231 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IL6P05231 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IL6P05231 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL6P05231 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL6P05231 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL6P05231 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL6P05231 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL6P05231 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IL6P05231 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IL6P05231 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IL6P05231 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IL6P05231 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IL6P05231 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL6P05231 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL6P05231 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL6P05231 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL6P05231 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL6P05231 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL6P05231 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL6P05231 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IL6P05231 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IL6P05231 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IL6P05231 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IL6P05231 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IL6P05231 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IL6P05231 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL6P05231 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL6P05231 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL6P05231 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL6P05231 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL6P05231 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL6P05231 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL6P05231 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL6P05231 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL6P05231 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL6P05231 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL6P05231 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL6P05231 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL6P05231 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL6P05231 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL6P05231 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL6P05231 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL6P05231 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL6P05231 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL6P05231 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL6P05231 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IL6P05231 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL6P05231 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IL6P05231 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL6P05231 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL6P05231 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL6P05231 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL6P05231 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL6P05231 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL6P05231 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL6P05231 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL6P05231 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL6P05231 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL6P05231 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IL6P05231 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL6P05231 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IL6P05231 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL6P05231 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL6P05231 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL6P05231 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL6P05231 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL6P05231 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL6P05231 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL6P05231 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL6P05231 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IL6P05231 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IL6P05231 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL6P05231 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL6P05231 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL6P05231 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL6P05231 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL6P05231 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL6P05231 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IL6P05231 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL6P05231 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL6P05231 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL6P05231 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL6P05231 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL6P05231 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL6P05231 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL6P05231 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL6P05231 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL6P05231 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL6P05231 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms