Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYCNP04198 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYCNP04198 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYCNP04198 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYCNP04198 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYCNP04198 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYCNP04198 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYCNP04198 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYCNP04198 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYCNP04198 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYCNP04198 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYCNP04198 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYCNP04198 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MYCNP04198 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYCNP04198 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYCNP04198 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYCNP04198 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYCNP04198 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYCNP04198 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYCNP04198 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MYCNP04198 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYCNP04198 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYCNP04198 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYCNP04198 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYCNP04198 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MYCNP04198 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MYCNP04198 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYCNP04198 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYCNP04198 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYCNP04198 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYCNP04198 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYCNP04198 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYCNP04198 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYCNP04198 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MYCNP04198 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MYCNP04198 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYCNP04198 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYCNP04198 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYCNP04198 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MYCNP04198 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MYCNP04198 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYCNP04198 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYCNP04198 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MYCNP04198 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYCNP04198 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYCNP04198 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYCNP04198 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MYCNP04198 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYCNP04198 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYCNP04198 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYCNP04198 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYCNP04198 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYCNP04198 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MYCNP04198 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYCNP04198 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYCNP04198 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYCNP04198 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MYCNP04198 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MYCNP04198 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYCNP04198 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYCNP04198 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MYCNP04198 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYCNP04198 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYCNP04198 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYCNP04198 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYCNP04198 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYCNP04198 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MYCNP04198 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MYCNP04198 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYCNP04198 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYCNP04198 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYCNP04198 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYCNP04198 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYCNP04198 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYCNP04198 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYCNP04198 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYCNP04198 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYCNP04198 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYCNP04198 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYCNP04198 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYCNP04198 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYCNP04198 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYCNP04198 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYCNP04198 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYCNP04198 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYCNP04198 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MYCNP04198 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYCNP04198 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MYCNP04198 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYCNP04198 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYCNP04198 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYCNP04198 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYCNP04198 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MYCNP04198 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYCNP04198 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYCNP04198 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MYCNP04198 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYCNP04198 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYCNP04198 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYCNP04198 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms