Protein–RNA interactions for Protein: P04196

HRG, Histidine-rich glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRGP04196 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRGP04196 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HRGP04196 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HRGP04196 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRGP04196 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRGP04196 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRGP04196 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRGP04196 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRGP04196 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRGP04196 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRGP04196 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRGP04196 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRGP04196 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRGP04196 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRGP04196 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRGP04196 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HRGP04196 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HRGP04196 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRGP04196 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HRGP04196 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRGP04196 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRGP04196 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRGP04196 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRGP04196 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HRGP04196 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRGP04196 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRGP04196 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HRGP04196 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HRGP04196 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRGP04196 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRGP04196 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRGP04196 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRGP04196 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRGP04196 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRGP04196 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HRGP04196 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HRGP04196 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HRGP04196 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HRGP04196 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HRGP04196 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HRGP04196 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HRGP04196 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HRGP04196 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HRGP04196 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HRGP04196 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HRGP04196 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HRGP04196 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HRGP04196 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HRGP04196 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HRGP04196 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HRGP04196 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HRGP04196 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HRGP04196 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HRGP04196 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HRGP04196 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HRGP04196 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HRGP04196 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRGP04196 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRGP04196 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRGP04196 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRGP04196 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRGP04196 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRGP04196 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRGP04196 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRGP04196 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRGP04196 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRGP04196 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRGP04196 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRGP04196 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRGP04196 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRGP04196 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRGP04196 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRGP04196 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRGP04196 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRGP04196 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRGP04196 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HRGP04196 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HRGP04196 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRGP04196 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HRGP04196 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRGP04196 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRGP04196 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRGP04196 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRGP04196 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRGP04196 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRGP04196 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRGP04196 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRGP04196 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRGP04196 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRGP04196 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRGP04196 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRGP04196 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRGP04196 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRGP04196 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRGP04196 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRGP04196 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRGP04196 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRGP04196 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRGP04196 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRGP04196 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms