Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN1SWP03999 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPN1SWP03999 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN1SWP03999 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms