Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PEX11BO96011 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX11BO96011 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX11BO96011 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX11BO96011 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX11BO96011 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms