Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APBB3O95704 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APBB3O95704 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APBB3O95704 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APBB3O95704 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APBB3O95704 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APBB3O95704 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APBB3O95704 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APBB3O95704 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APBB3O95704 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APBB3O95704 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APBB3O95704 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APBB3O95704 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
APBB3O95704 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APBB3O95704 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APBB3O95704 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
APBB3O95704 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APBB3O95704 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBB3O95704 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBB3O95704 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBB3O95704 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
APBB3O95704 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBB3O95704 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBB3O95704 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBB3O95704 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
APBB3O95704 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBB3O95704 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBB3O95704 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBB3O95704 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBB3O95704 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBB3O95704 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
APBB3O95704 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBB3O95704 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBB3O95704 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBB3O95704 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBB3O95704 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBB3O95704 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBB3O95704 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBB3O95704 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
APBB3O95704 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBB3O95704 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBB3O95704 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBB3O95704 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBB3O95704 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBB3O95704 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBB3O95704 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APBB3O95704 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APBB3O95704 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APBB3O95704 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APBB3O95704 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
APBB3O95704 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBB3O95704 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBB3O95704 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBB3O95704 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBB3O95704 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APBB3O95704 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
APBB3O95704 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APBB3O95704 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APBB3O95704 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APBB3O95704 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APBB3O95704 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APBB3O95704 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
APBB3O95704 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APBB3O95704 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APBB3O95704 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APBB3O95704 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APBB3O95704 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APBB3O95704 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APBB3O95704 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APBB3O95704 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APBB3O95704 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
APBB3O95704 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APBB3O95704 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APBB3O95704 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APBB3O95704 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APBB3O95704 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APBB3O95704 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APBB3O95704 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APBB3O95704 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APBB3O95704 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APBB3O95704 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APBB3O95704 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APBB3O95704 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
APBB3O95704 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
APBB3O95704 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
APBB3O95704 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APBB3O95704 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APBB3O95704 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APBB3O95704 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APBB3O95704 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APBB3O95704 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APBB3O95704 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APBB3O95704 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APBB3O95704 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
APBB3O95704 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBB3O95704 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBB3O95704 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBB3O95704 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APBB3O95704 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBB3O95704 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms