Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL3O95164 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL3O95164 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL3O95164 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL3O95164 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL3O95164 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL3O95164 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL3O95164 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL3O95164 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL3O95164 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL3O95164 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL3O95164 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL3O95164 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL3O95164 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBL3O95164 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL3O95164 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL3O95164 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL3O95164 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL3O95164 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL3O95164 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL3O95164 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL3O95164 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL3O95164 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL3O95164 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL3O95164 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL3O95164 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL3O95164 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL3O95164 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL3O95164 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL3O95164 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL3O95164 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL3O95164 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL3O95164 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL3O95164 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL3O95164 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL3O95164 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL3O95164 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL3O95164 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBL3O95164 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL3O95164 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL3O95164 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL3O95164 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL3O95164 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL3O95164 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL3O95164 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL3O95164 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL3O95164 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL3O95164 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL3O95164 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL3O95164 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL3O95164 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL3O95164 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL3O95164 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL3O95164 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL3O95164 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL3O95164 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL3O95164 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL3O95164 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL3O95164 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL3O95164 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBL3O95164 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBL3O95164 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBL3O95164 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBL3O95164 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBL3O95164 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBL3O95164 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBL3O95164 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBL3O95164 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBL3O95164 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBL3O95164 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBL3O95164 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBL3O95164 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBL3O95164 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBL3O95164 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBL3O95164 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBL3O95164 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBL3O95164 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBL3O95164 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBL3O95164 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBL3O95164 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBL3O95164 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBL3O95164 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBL3O95164 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBL3O95164 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBL3O95164 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBL3O95164 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBL3O95164 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL3O95164 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL3O95164 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL3O95164 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL3O95164 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL3O95164 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL3O95164 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL3O95164 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL3O95164 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL3O95164 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL3O95164 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL3O95164 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL3O95164 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL3O95164 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms