Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KATNA1O75449 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KATNA1O75449 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KATNA1O75449 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms