Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRP3O75074 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRP3O75074 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRP3O75074 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRP3O75074 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRP3O75074 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP3O75074 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP3O75074 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP3O75074 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP3O75074 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRP3O75074 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP3O75074 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP3O75074 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP3O75074 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRP3O75074 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP3O75074 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP3O75074 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRP3O75074 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP3O75074 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP3O75074 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRP3O75074 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP3O75074 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP3O75074 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP3O75074 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP3O75074 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRP3O75074 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRP3O75074 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRP3O75074 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRP3O75074 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRP3O75074 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRP3O75074 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRP3O75074 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRP3O75074 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRP3O75074 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRP3O75074 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRP3O75074 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRP3O75074 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRP3O75074 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRP3O75074 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRP3O75074 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRP3O75074 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRP3O75074 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRP3O75074 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRP3O75074 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRP3O75074 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRP3O75074 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRP3O75074 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRP3O75074 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRP3O75074 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRP3O75074 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRP3O75074 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRP3O75074 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRP3O75074 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRP3O75074 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRP3O75074 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRP3O75074 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP3O75074 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP3O75074 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP3O75074 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRP3O75074 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP3O75074 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP3O75074 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP3O75074 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP3O75074 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP3O75074 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP3O75074 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP3O75074 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP3O75074 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP3O75074 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP3O75074 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP3O75074 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP3O75074 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP3O75074 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP3O75074 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP3O75074 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP3O75074 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP3O75074 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP3O75074 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP3O75074 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP3O75074 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP3O75074 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP3O75074 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP3O75074 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP3O75074 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP3O75074 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP3O75074 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP3O75074 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP3O75074 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP3O75074 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP3O75074 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP3O75074 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP3O75074 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP3O75074 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP3O75074 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP3O75074 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP3O75074 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP3O75074 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP3O75074 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP3O75074 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP3O75074 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms