Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBNO60934 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBNO60934 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBNO60934 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBNO60934 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBNO60934 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBNO60934 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBNO60934 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NBNO60934 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBNO60934 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBNO60934 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBNO60934 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBNO60934 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBNO60934 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBNO60934 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBNO60934 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBNO60934 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBNO60934 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBNO60934 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBNO60934 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBNO60934 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBNO60934 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBNO60934 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBNO60934 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBNO60934 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBNO60934 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBNO60934 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBNO60934 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBNO60934 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBNO60934 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBNO60934 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBNO60934 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBNO60934 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBNO60934 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBNO60934 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBNO60934 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBNO60934 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NBNO60934 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NBNO60934 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBNO60934 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBNO60934 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBNO60934 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBNO60934 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBNO60934 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBNO60934 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBNO60934 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBNO60934 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBNO60934 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBNO60934 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NBNO60934 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBNO60934 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBNO60934 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NBNO60934 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NBNO60934 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBNO60934 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBNO60934 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBNO60934 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBNO60934 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NBNO60934 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBNO60934 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBNO60934 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBNO60934 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBNO60934 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NBNO60934 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBNO60934 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBNO60934 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBNO60934 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NBNO60934 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBNO60934 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBNO60934 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NBNO60934 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBNO60934 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBNO60934 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBNO60934 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBNO60934 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NBNO60934 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBNO60934 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NBNO60934 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBNO60934 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBNO60934 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NBNO60934 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBNO60934 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBNO60934 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBNO60934 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBNO60934 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBNO60934 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBNO60934 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBNO60934 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBNO60934 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBNO60934 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBNO60934 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBNO60934 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBNO60934 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBNO60934 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBNO60934 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBNO60934 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBNO60934 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBNO60934 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBNO60934 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBNO60934 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms