Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LANCL1O43813 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LANCL1O43813 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1552 ms