Protein–RNA interactions for Protein: O43325

LYRM1, LYR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM1O43325 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYRM1O43325 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYRM1O43325 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYRM1O43325 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LYRM1O43325 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYRM1O43325 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYRM1O43325 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYRM1O43325 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYRM1O43325 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms