Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RGPD8O14715 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RGPD8O14715 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RGPD8O14715 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RGPD8O14715 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RGPD8O14715 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RGPD8O14715 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RGPD8O14715 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RGPD8O14715 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RGPD8O14715 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
RGPD8O14715 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RGPD8O14715 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RGPD8O14715 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RGPD8O14715 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RGPD8O14715 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RGPD8O14715 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.7■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RGPD8O14715 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
RGPD8O14715 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RGPD8O14715 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms