Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
J3QKU1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3QKU1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3QKU1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3QKU1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3QKU1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3QKU1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3QKU1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3QKU1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QKU1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QKU1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QKU1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QKU1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QKU1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3QKU1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
J3QKU1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3QKU1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3QKU1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3QKU1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3QKU1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3QKU1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3QKU1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3QKU1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3QKU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3QKU1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3QKU1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
J3QKU1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
J3QKU1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3QKU1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QKU1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QKU1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QKU1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QKU1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QKU1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QKU1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QKU1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QKU1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QKU1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QKU1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QKU1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3QKU1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3QKU1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3QKU1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3QKU1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3QKU1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3QKU1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3QKU1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3QKU1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3QKU1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3QKU1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3QKU1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
J3QKU1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QKU1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QKU1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QKU1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QKU1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QKU1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QKU1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3QKU1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
J3QKU1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3QKU1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3QKU1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3QKU1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3QKU1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
J3QKU1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3QKU1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3QKU1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
J3QKU1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QKU1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QKU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QKU1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QKU1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
J3QKU1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
J3QKU1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3QKU1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3QKU1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QKU1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QKU1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QKU1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QKU1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QKU1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QKU1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
J3QKU1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3QKU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
J3QKU1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3QKU1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3QKU1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3QKU1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
J3QKU1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3QKU1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3QKU1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3QKU1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3QKU1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms