Protein–RNA interactions for Protein: H3BSH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSH0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BSH0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BSH0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BSH0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BSH0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BSH0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BSH0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BSH0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BSH0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H3BSH0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H3BSH0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BSH0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BSH0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BSH0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BSH0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BSH0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BSH0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BSH0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BSH0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BSH0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BSH0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BSH0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BSH0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BSH0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BSH0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BSH0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSH0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSH0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSH0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSH0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSH0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BSH0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H3BSH0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BSH0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BSH0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BSH0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSH0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BSH0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSH0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSH0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSH0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSH0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSH0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSH0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSH0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSH0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSH0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BSH0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BSH0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BSH0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BSH0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BSH0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSH0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSH0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSH0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSH0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSH0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BSH0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BSH0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BSH0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BSH0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BSH0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BSH0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSH0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSH0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSH0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSH0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSH0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSH0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSH0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSH0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BSH0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BSH0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BSH0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BSH0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BSH0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BSH0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BSH0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BSH0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BSH0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSH0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSH0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSH0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSH0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSH0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSH0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSH0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSH0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSH0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BSH0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BSH0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BSH0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BSH0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BSH0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BSH0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BSH0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BSH0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
H3BSH0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BSH0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BSH0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms