Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYSRT1A8MQ03 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYSRT1A8MQ03 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYSRT1A8MQ03 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYSRT1A8MQ03 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYSRT1A8MQ03 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms