Protein–RNA interactions for Protein: A6NNC1

Putative POM121-like protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNC1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNC1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NNC1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NNC1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NNC1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNC1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNC1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNC1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNC1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNC1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNC1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNC1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A6NNC1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A6NNC1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A6NNC1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNC1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNC1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNC1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNC1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNC1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNC1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNC1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNC1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNC1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNC1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNC1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NNC1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NNC1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NNC1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NNC1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NNC1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NNC1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NNC1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NNC1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NNC1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NNC1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NNC1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NNC1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NNC1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NNC1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NNC1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NNC1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NNC1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NNC1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NNC1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NNC1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NNC1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NNC1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NNC1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NNC1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNC1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNC1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNC1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNC1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NNC1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NNC1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A6NNC1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNC1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNC1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNC1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NNC1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NNC1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNC1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNC1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNC1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNC1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNC1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNC1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NNC1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNC1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NNC1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNC1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNC1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNC1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NNC1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNC1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNC1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNC1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNC1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNC1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNC1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NNC1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNC1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNC1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNC1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNC1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNC1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNC1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNC1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNC1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNC1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNC1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNC1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNC1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNC1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNC1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNC1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNC1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNC1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNC1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms