Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCCD1A6NED2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCCD1A6NED2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCCD1A6NED2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCCD1A6NED2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RCCD1A6NED2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms