Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWA3AA6NCI4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VWA3AA6NCI4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWA3AA6NCI4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VWA3AA6NCI4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms